More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1478 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  47.16 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.21 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.39 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.92 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.33 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  43.08 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  42.81 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.72 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.05 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.82 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.31 
 
 		 333 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.51 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.99 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.52 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  42.09 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.5 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.88 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.67 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.23 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.34 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.8 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.21 
 
 		 322 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.45 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.58 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.71 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.58 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  40.27 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.86 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.86 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.47 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.83 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.13 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  40.74 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.72 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.02 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.37 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.83 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.67 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.19 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.79 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.2 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.91 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  40.86 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  41.45 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.37 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.06 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.19 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.79 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  42 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.33 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.42 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.04 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.53 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.8 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.61 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.51 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.68 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.76 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  41.42 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.95 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.53 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.47 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.17 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  38.44 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  41.84 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  40.6 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  39.14 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.05 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.79 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>