95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5031 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  100 
 
 		 119 aa  233  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  86.55 
 
 		 119 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  53.91 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  55.93 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  51.72 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  58.97 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  51.24 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  50.44 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  50.89 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  54.7 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  48.36 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  48.36 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  48.36 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  58.67 
 
 		 221 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  57.33 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  57.33 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  57.33 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  47.54 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  47.54 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 		 222 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  57.33 
 
 		 221 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  57.33 
 
 		 221 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  57.33 
 
 		 294 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  49.52 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  50.44 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  45.9 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  44.25 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  42.86 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  42.99 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  38.98 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  43.48 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  43.48 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  44.74 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  42.11 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  37.39 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  45.83 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  45 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  45 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  38.14 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  45 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  38.32 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  44.44 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  35.04 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  31.3 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  36.11 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  48 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  48 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  35.62 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  39.06 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  32.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  44 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  44 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  31.62 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  53.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.91 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.86 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  37.88 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  44 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  36.36 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  46 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  37.33 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.86 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.86 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  42 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  47.06 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  37.14 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  37.88 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.86 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  37.88 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  48.89 
 
 		 218 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  28.57 
 
 		 307 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  33.82 
 
 		 170 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  42.37 
 
 		 163 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  38.98 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1030  transport-associated protein  28.68 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  31.82 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  47.73 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  47.73 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0139  transport-associated  33.33 
 
 		 160 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  34.85 
 
 		 201 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>