More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2159 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  95.89 
 
 		 438 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  63.87 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  63.62 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  64.39 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  63.64 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  63.92 
 
 		 445 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  64.27 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  50.69 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  50.69 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.41 
 
 		 468 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.12 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.55 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.08 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  46.06 
 
 		 443 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  43.15 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  44.39 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.27 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 439 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.96 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.04 
 
 		 438 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  42.31 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.39 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.39 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.39 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.52 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  43.42 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.46 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.63 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.58 
 
 		 447 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.63 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.83 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 459 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.16 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.29 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.86 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.73 
 
 		 482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.43 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.56 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.62 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.44 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 450 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  42.36 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  41.57 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  42.23 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  41.59 
 
 		 433 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  41.11 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  40.87 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  40.87 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.44 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.91 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39.91 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>