More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1259 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  83.08 
 
 		 419 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 419 aa  856    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.4 
 
 		 420 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.83 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.83 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.15 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.15 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.83 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.83 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.64 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  40.92 
 
 		 420 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  44.67 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.39 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  48.63 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  47.8 
 
 		 348 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  48.89 
 
 		 369 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  42.95 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  51.97 
 
 		 375 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 		 1032 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.81 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  41.75 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  44.3 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  41.06 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  28.47 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.47 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.75 
 
 		 498 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.8 
 
 		 465 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.67 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.32 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  38.46 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  43.48 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.34 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  33 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.65 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 387 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.8 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  40.27 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 660 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.8 
 
 		 365 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  37.06 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25.56 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.94 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  28.95 
 
 		 513 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  34.57 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 356 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  34.5 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  32.82 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>