233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0489 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  88.85 
 
 
270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  70.8 
 
 
289 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  68.94 
 
 
262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  68.56 
 
 
262 aa  334  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  69.65 
 
 
266 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  68.9 
 
 
266 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  68.08 
 
 
262 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  68.5 
 
 
259 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  69.69 
 
 
265 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  69.69 
 
 
265 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  67.72 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  40.78 
 
 
295 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  37.02 
 
 
293 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  36.97 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  39.5 
 
 
277 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  41.13 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  41.2 
 
 
245 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  36.63 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  36.63 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  37.78 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.47 
 
 
238 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  34.81 
 
 
254 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  33.7 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.93 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.58 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  32.71 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.81 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.08 
 
 
256 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  33.33 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  34.36 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.56 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.84 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.59 
 
 
251 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.88 
 
 
269 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.41 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  32.06 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  31.03 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  31.1 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.8 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  36.9 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.11 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  30.86 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.48 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  31.01 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  30.97 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  30.94 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  37.75 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.42 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  29.77 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  34.01 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  29.39 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  30.89 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.67 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.62 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  29.61 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.91 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  30.17 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.12 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.32 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  27.88 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.2 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  26.74 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  28.57 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  26.77 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.49 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  27.75 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  31.9 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  30.82 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.49 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  28.8 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.91 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.5 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  34.42 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.26 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.91 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.17 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.17 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  26.26 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  31.76 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  27.17 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  31.97 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0177  pantothenate kinase  28.12 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.676311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.49 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  31.42 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.12 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  33.73 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  28.75 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.84 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  28.75 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  27.67 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.48 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.82 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>