More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5065 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  95.84 
 
 
460 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  94.38 
 
 
445 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  93.71 
 
 
445 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  95.84 
 
 
460 aa  792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  93.93 
 
 
445 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  93.71 
 
 
445 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  76.42 
 
 
433 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  63.92 
 
 
438 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.62 
 
 
438 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  48.69 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
452 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  48.37 
 
 
444 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  50.23 
 
 
461 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.84 
 
 
437 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  47.97 
 
 
433 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.65 
 
 
468 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.5 
 
 
450 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.12 
 
 
443 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.3 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.3 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.3 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.04 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
461 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.5 
 
 
442 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.77 
 
 
460 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.72 
 
 
437 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 
431 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.06 
 
 
456 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.44 
 
 
450 aa  330  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.31 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.44 
 
 
439 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.08 
 
 
455 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.08 
 
 
439 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.07 
 
 
437 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.67 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.23 
 
 
439 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.58 
 
 
447 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.9 
 
 
439 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.7 
 
 
460 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  41.9 
 
 
459 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  46.95 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.2 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.2 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.2 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.79 
 
 
450 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.41 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.97 
 
 
439 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  42.69 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
446 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.75 
 
 
447 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
432 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.6 
 
 
458 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.74 
 
 
459 aa  315  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.82 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.86 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.86 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.86 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  42.22 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.61 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  43.2 
 
 
456 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.53 
 
 
455 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.84 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.55 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.16 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.32 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.45 
 
 
463 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  40.88 
 
 
435 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.87 
 
 
435 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.87 
 
 
435 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.76 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.78 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  39.62 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.41 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  40.41 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.41 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.3 
 
 
439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.77 
 
 
436 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.5 
 
 
451 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.71 
 
 
445 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  41.08 
 
 
454 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.81 
 
 
441 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.52 
 
 
430 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  46.54 
 
 
452 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.7 
 
 
442 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  43.68 
 
 
457 aa  299  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.77 
 
 
437 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
453 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
442 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.4 
 
 
439 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.61 
 
 
457 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.61 
 
 
457 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.61 
 
 
457 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.05 
 
 
430 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 
437 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.26 
 
 
441 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>