73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1873 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0628  porin  75.25 
 
 		 529 aa  781    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  100 
 
 		 516 aa  1045    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  72.99 
 
 		 513 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  56.12 
 
 		 561 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  35.69 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  35.09 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  34.67 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  34.34 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  33.98 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  34.52 
 
 		 550 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  33.62 
 
 		 553 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  34.43 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  32.99 
 
 		 559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  34.32 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  33.95 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  33.95 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  34.12 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  32.65 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  32.48 
 
 		 554 aa  223  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  33.09 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  32.64 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  32.39 
 
 		 546 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  32.3 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  34.55 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  33.16 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  34.68 
 
 		 488 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  34.75 
 
 		 484 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  34.36 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  33.27 
 
 		 565 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  32.73 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  34.77 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  33.97 
 
 		 483 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  34.2 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  30.24 
 
 		 547 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  29.73 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  31.33 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  33.15 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  32.06 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  31.52 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  33.2 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  31.8 
 
 		 519 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  31.89 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  30.09 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  28.48 
 
 		 386 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  30.07 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  30.75 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  29.6 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  28.67 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  30.53 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  27.76 
 
 		 372 aa  90.5  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  31.02 
 
 		 401 aa  90.5  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  29.22 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  26.09 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  29.56 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  28.79 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  27.16 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  27.46 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  69.23 
 
 		 338 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  32.73 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  66.67 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  27.33 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  62.22 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  62.22 
 
 		 342 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  77.42 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  77.42 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  37.5 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  28.05 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  70.59 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  23.77 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  37.37 
 
 		 107 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  23.89 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  27.81 
 
 		 351 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>