More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1199 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.85 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 295 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 298 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  29.27 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  30.45 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.96 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  31.74 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>