92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  100 
 
 
391 aa  758    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.5 
 
 
377 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.64 
 
 
377 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.68 
 
 
372 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.39 
 
 
371 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.64 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  46.23 
 
 
202 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  42.42 
 
 
200 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.06 
 
 
202 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.9 
 
 
196 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.63 
 
 
195 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.9 
 
 
196 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  41.79 
 
 
197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.88 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  39.02 
 
 
199 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.36 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  40.1 
 
 
197 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.38 
 
 
210 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.71 
 
 
369 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  38 
 
 
196 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.9 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.6 
 
 
197 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.6 
 
 
197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.46 
 
 
204 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.86 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.98 
 
 
196 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.6 
 
 
196 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  39.11 
 
 
197 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.12 
 
 
197 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  38.73 
 
 
191 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.68 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.9 
 
 
191 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.38 
 
 
192 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.44 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  31.9 
 
 
195 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 
191 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.28 
 
 
192 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.84 
 
 
201 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.09 
 
 
214 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  24.74 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  31.46 
 
 
192 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.82 
 
 
202 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.93 
 
 
196 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  24.74 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  28.12 
 
 
214 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  32.43 
 
 
191 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
196 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.29 
 
 
194 aa  52.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  24.74 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.28 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.76 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  29.8 
 
 
201 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.71 
 
 
209 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.45 
 
 
186 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  35.48 
 
 
186 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.28 
 
 
210 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  28.96 
 
 
202 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.77 
 
 
190 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
192 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.62 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  27.92 
 
 
194 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28 
 
 
192 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 
198 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.68 
 
 
192 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.66 
 
 
192 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.12 
 
 
192 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.17 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.97 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.73 
 
 
192 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 
194 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 
199 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.68 
 
 
192 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  27.4 
 
 
191 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.25 
 
 
200 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 
195 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  33.54 
 
 
183 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  26.29 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  27.81 
 
 
194 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9083  peroxidase family protein  33.56 
 
 
186 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.01 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
192 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.87 
 
 
208 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.87 
 
 
208 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  26.87 
 
 
208 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.98 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 
192 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  25.76 
 
 
151 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>