51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7326 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  100 
 
 
230 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  63.44 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  63.44 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  63.44 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  65.04 
 
 
232 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  59.21 
 
 
236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  60.27 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  59.46 
 
 
236 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  55.98 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  56.14 
 
 
225 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  56.04 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  43.42 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  44 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  33.73 
 
 
485 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  43.86 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  30.97 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  32.93 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.66 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  24.66 
 
 
668 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  48.84 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  34.15 
 
 
156 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  35.09 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  41.46 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  24.82 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  26.37 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.88 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  41.18 
 
 
371 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  35.53 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.04 
 
 
447 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  49.02 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  38.46 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  41.86 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  43.24 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  37.5 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  40 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.45 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.45 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  37.5 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  42 
 
 
565 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  37.5 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  25.14 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  36 
 
 
438 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  39.71 
 
 
371 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  42.86 
 
 
340 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  23.64 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>