More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1740 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  93.52 
 
 		 494 aa  918    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  93.72 
 
 		 494 aa  916    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 494 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  91.7 
 
 		 509 aa  900    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  88.56 
 
 		 495 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  93.72 
 
 		 494 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  92.31 
 
 		 494 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 490 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  68.44 
 
 		 574 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  64.33 
 
 		 490 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  68.3 
 
 		 493 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  68.1 
 
 		 570 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  68.3 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  62.81 
 
 		 489 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  61.93 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.27 
 
 		 485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  52.93 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 473 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  49.89 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.53 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.83 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 477 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  42.98 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 501 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 490 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.36 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.4 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 510 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.84 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 485 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 501 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.49 
 
 		 485 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 492 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 503 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.55 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.82 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.39 
 
 		 497 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 		 497 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.58 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 485 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 486 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 493 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.32 
 
 		 496 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 467 aa  269  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 503 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 475 aa  269  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.38 
 
 		 499 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.95 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.03 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  38 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 495 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.52 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.9 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.55 
 
 		 514 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>