More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0152 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  88.45 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  88.45 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  31.84 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  35.39 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  35.44 
 
 		 241 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  35.46 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  26.42 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  29.5 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  28.33 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  27.16 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  30.61 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  25.55 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  27.73 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.18 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.54 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.73 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  29.96 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.97 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  29.95 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  23.56 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  30.04 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.32 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.24 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  25.43 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.07 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  22.98 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  22.98 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  22.98 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  22.98 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  22.98 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  26.52 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.27 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  24.26 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.46 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.24 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  23.81 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.24 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  22.61 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  22.61 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>