204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4636 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  100 
 
 
3718 aa  7088    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  38.96 
 
 
4191 aa  790    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  60.64 
 
 
1072 aa  561  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  52.71 
 
 
3355 aa  444  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.45 
 
 
3126 aa  370  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  37.08 
 
 
990 aa  350  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  37.07 
 
 
963 aa  298  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  31.86 
 
 
3192 aa  288  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.62 
 
 
4384 aa  271  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  34.66 
 
 
1613 aa  270  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.28 
 
 
2832 aa  262  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  32.46 
 
 
2868 aa  249  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  35.22 
 
 
735 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.46 
 
 
1616 aa  215  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.46 
 
 
1616 aa  215  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1074 aa  212  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1122 aa  211  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1122 aa  211  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1090 aa  211  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1090 aa  211  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  33.21 
 
 
1090 aa  211  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  33.09 
 
 
1122 aa  209  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  33.22 
 
 
1246 aa  207  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.07 
 
 
1451 aa  193  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 
1125 aa  189  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  57.61 
 
 
1186 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  57.61 
 
 
1068 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  57.61 
 
 
1012 aa  187  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  57.61 
 
 
962 aa  187  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  34.14 
 
 
2157 aa  186  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.11 
 
 
753 aa  182  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  29.03 
 
 
1204 aa  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  37.26 
 
 
1326 aa  174  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  34.95 
 
 
4726 aa  173  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.9 
 
 
1197 aa  167  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.9 
 
 
1197 aa  167  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.44 
 
 
1588 aa  166  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  48.78 
 
 
373 aa  165  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  48.78 
 
 
378 aa  165  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  48.78 
 
 
373 aa  165  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  28.75 
 
 
1197 aa  163  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.17 
 
 
1549 aa  163  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  51.1 
 
 
192 aa  161  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  51.1 
 
 
192 aa  161  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  53.07 
 
 
1654 aa  160  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  27.01 
 
 
1472 aa  158  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  48.97 
 
 
533 aa  157  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  51.12 
 
 
715 aa  154  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  46.15 
 
 
378 aa  154  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  51.12 
 
 
1626 aa  154  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  51.12 
 
 
1705 aa  154  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  51.12 
 
 
1669 aa  153  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  51.12 
 
 
1766 aa  153  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  51.12 
 
 
1535 aa  153  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  46.15 
 
 
460 aa  153  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  50.58 
 
 
1309 aa  151  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  47.98 
 
 
827 aa  150  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  48.59 
 
 
617 aa  148  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  53.95 
 
 
2141 aa  147  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.57 
 
 
1616 aa  145  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  47.73 
 
 
525 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.73 
 
 
1674 aa  143  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  41.23 
 
 
3635 aa  141  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  51.32 
 
 
737 aa  139  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.86 
 
 
597 aa  137  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.86 
 
 
597 aa  137  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.59 
 
 
597 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  51.35 
 
 
135 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  51.35 
 
 
135 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  47.78 
 
 
650 aa  134  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.79 
 
 
1713 aa  128  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  31.65 
 
 
1417 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  35.07 
 
 
967 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  37.69 
 
 
877 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  35.76 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.99 
 
 
589 aa  113  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.86 
 
 
536 aa  108  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  40.38 
 
 
472 aa  108  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.92 
 
 
1117 aa  105  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  44.44 
 
 
977 aa  100  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.46 
 
 
810 aa  100  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  31.91 
 
 
880 aa  99.8  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  27.16 
 
 
1447 aa  99.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  35.92 
 
 
989 aa  98.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  36.92 
 
 
322 aa  97.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  26.89 
 
 
1447 aa  97.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 
459 aa  97.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  40.22 
 
 
876 aa  97.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 
459 aa  97.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 
459 aa  97.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  37.7 
 
 
1616 aa  96.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  37.7 
 
 
1608 aa  96.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 
229 aa  96.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  34.57 
 
 
1265 aa  94.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  38.04 
 
 
1190 aa  94.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 
548 aa  94  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.72 
 
 
878 aa  93.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  29.59 
 
 
1516 aa  93.2  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  37.35 
 
 
2392 aa  92.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  35.73 
 
 
601 aa  92.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>