281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1764 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1764  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  94.62 
 
 		 438 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5703  hypothetical protein  67.86 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  69.23 
 
 		 391 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5244  hypothetical protein  68.63 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  62.75 
 
 		 402 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  61.54 
 
 		 404 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  61.54 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  61.54 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  69.57 
 
 		 417 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0136  hypothetical protein  53.12 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  67.39 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  67.39 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  59.62 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  61.54 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  53.45 
 
 		 420 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  57.69 
 
 		 416 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  56.86 
 
 		 429 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  59.18 
 
 		 404 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  55.77 
 
 		 404 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  55.77 
 
 		 404 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  56.6 
 
 		 419 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  58.82 
 
 		 421 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  59.62 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  63.83 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  56.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  55.77 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  58.82 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  58.82 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  58.82 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  55.77 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  53.45 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  65.22 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  65.31 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  55.77 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  53.85 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  53.85 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  56.86 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  63.04 
 
 		 404 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  54.72 
 
 		 421 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  47.14 
 
 		 445 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  55.77 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  57.69 
 
 		 401 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  58.82 
 
 		 418 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  58.82 
 
 		 419 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  58.82 
 
 		 418 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  54.9 
 
 		 420 aa  66.6  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  63.04 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  54.39 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  63.04 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  54.9 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  57.69 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  63.04 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  54.9 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  52.94 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  52.94 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.94 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.94 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  54.9 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  54.9 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  60.87 
 
 		 424 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4097  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  59.57 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  58.7 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  56.86 
 
 		 425 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  60.87 
 
 		 428 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  50.98 
 
 		 420 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 		 397 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  58.33 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  51.72 
 
 		 403 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  53.85 
 
 		 411 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  51.92 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  60.87 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.94 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  49.02 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  59.57 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  40.51 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  63.04 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  50.85 
 
 		 419 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  60 
 
 		 397 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  60.87 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  53.85 
 
 		 401 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  52.94 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  59.57 
 
 		 414 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  54.9 
 
 		 406 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2095  integrase  49.02 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  54.9 
 
 		 404 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  52.94 
 
 		 424 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  51.92 
 
 		 413 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  49.02 
 
 		 319 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 		 387 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  50 
 
 		 438 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2185  integrase  43.75 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  44.78 
 
 		 410 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  49.06 
 
 		 409 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  58.7 
 
 		 404 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  58.7 
 
 		 404 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  46.15 
 
 		 404 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>