More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3747 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  100 
 
 		 454 aa  843    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  34.12 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.18 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  24.35 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  32.58 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  32.29 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  30.39 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  34.81 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  29.91 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.67 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.67 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1730  DNA binding domain protein, excisionase family  33.71 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0738668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  28.57 
 
 		 378 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  29.4 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  23.54 
 
 		 373 aa  114  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  25.74 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  25.74 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  29.71 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  31.98 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  30.22 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  31.5 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.06 
 
 		 382 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  25.66 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  26.41 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  26.41 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  26.41 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  26.41 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  26.41 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  25.2 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  26.41 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.79 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  25 
 
 		 371 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  23.67 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  23.67 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  36.28 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  27.69 
 
 		 380 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.99 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.52 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.67 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.45 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  28.38 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.74 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  28.95 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  29.33 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  26.28 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.76 
 
 		 377 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  31.59 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.54 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  29.23 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  33.68 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  28.12 
 
 		 393 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  30 
 
 		 378 aa  100  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  24.45 
 
 		 375 aa  100  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.53 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  31.59 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.07 
 
 		 373 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  32.16 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.93 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  25.17 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  29.41 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  31.78 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  29 
 
 		 407 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  33.7 
 
 		 362 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.75 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  38.77 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  29.29 
 
 		 373 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.04 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  34.92 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.9 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  22.75 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  22.75 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  22.75 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  31.61 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.27 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  38.16 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  28.89 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  28.7 
 
 		 381 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  22.81 
 
 		 372 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.78 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  22.49 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  27.84 
 
 		 397 aa  94  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.27 
 
 		 378 aa  94  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.3 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  26.65 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  22.68 
 
 		 373 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  22.49 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  32.42 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  22.49 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.38 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  22.25 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  33.48 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  26.78 
 
 		 378 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  27.86 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  26.76 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  22.93 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.92 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  31.36 
 
 		 431 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  28.34 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  37.32 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>