110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3367 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  71.81 
 
 
300 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  60.55 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.05 
 
 
298 aa  322  6e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.21 
 
 
279 aa  315  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  57.39 
 
 
288 aa  311  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  56.84 
 
 
285 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.98 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  56.99 
 
 
293 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.24 
 
 
269 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  54.36 
 
 
266 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.94 
 
 
290 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.77 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.13 
 
 
276 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  48.62 
 
 
292 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  45.96 
 
 
277 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  46.53 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.61 
 
 
394 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  37.76 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.73 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.08 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  43.84 
 
 
296 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  41.55 
 
 
276 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  40.07 
 
 
280 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  40.07 
 
 
280 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  40.07 
 
 
280 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.11 
 
 
278 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.72 
 
 
265 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  40.07 
 
 
280 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  39.72 
 
 
280 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  39.72 
 
 
280 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.44 
 
 
292 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.1 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.07 
 
 
286 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.68 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  34.15 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  33.68 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  32.06 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  27.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.23 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  36.5 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.15 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  31.43 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.79 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.17 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  27.95 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  29.18 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  28.8 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.72 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  23.46 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.16 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  22.22 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0291  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.15 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.102645  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  26.77 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  28.72 
 
 
250 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  25.61 
 
 
635 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.27 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  28.9 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.45 
 
 
638 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.67 
 
 
631 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3457  Hydroxypyruvate isomerase  27.8 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000196511  decreased coverage  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.16 
 
 
632 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  28.66 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.37 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.69 
 
 
604 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.49 
 
 
635 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  26.92 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29270  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.61 
 
 
280 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0606  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.64 
 
 
624 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0633938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  26.53 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.36 
 
 
635 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  31.52 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.75 
 
 
631 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.12 
 
 
635 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.12 
 
 
635 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  26.97 
 
 
259 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.47 
 
 
633 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1557  Hydroxypyruvate isomerase  31.89 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  31.62 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  33.97 
 
 
687 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  24.59 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  32.3 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0259  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  32.3 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  32.3 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3913  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 
617 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.974395  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.69 
 
 
630 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6113  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.1 
 
 
623 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 
615 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  26.63 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  28.95 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  25.99 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>