More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2583 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  100 
 
 		 373 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  51.8 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  61.16 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  62.09 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  48.41 
 
 		 340 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  50.86 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  48.66 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  47.08 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.84 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  45.36 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  45.37 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  44.41 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  47.32 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  47.32 
 
 		 336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  46.25 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  44.17 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.08 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  46.02 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  44.98 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  44.48 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  48.46 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  42.3 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  46.26 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  45.64 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  42.46 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  48.03 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  46.23 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  45.12 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  43.94 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  42.82 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  44.35 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  44.01 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  49.49 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  44.44 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  46.37 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  43.26 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  44.37 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  45.72 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  50.52 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  45.05 
 
 		 347 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  42.14 
 
 		 361 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  44.21 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  43.73 
 
 		 370 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  43.45 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  41.52 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  44.51 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  44.21 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  46.89 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  45.55 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.39 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.28 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  42.64 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  44.14 
 
 		 342 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.4 
 
 		 315 aa  189  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.71 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  43.71 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.53 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  46.53 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.3 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  37.1 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.36 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.36 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  43.73 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  42.32 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  40.83 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  39.38 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  43.1 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  43.75 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  45.15 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.7 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.81 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.58 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  36.39 
 
 		 350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  35.38 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  44.21 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.16 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.68 
 
 		 318 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.27 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  41.57 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.23 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  46.25 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  37.72 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  46.25 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.1 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.1 
 
 		 337 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  45.39 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  37.38 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.54 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.62 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  41.31 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  38.05 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  43.42 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.56 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  42 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  42 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  37.61 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>