36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1440 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
391 aa  762    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  48.55 
 
 
392 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  34.56 
 
 
391 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.3 
 
 
397 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.89 
 
 
559 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  36.83 
 
 
367 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  34.85 
 
 
388 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  28.68 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  32.63 
 
 
558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  29.27 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  32.68 
 
 
589 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  28.42 
 
 
526 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  29.97 
 
 
949 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  30.14 
 
 
399 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  29.57 
 
 
515 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  32.68 
 
 
978 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.79 
 
 
1015 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  31.5 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.22 
 
 
652 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  29.74 
 
 
1173 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  29.1 
 
 
674 aa  91.3  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 
549 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  30.05 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.22 
 
 
509 aa  77  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  28.06 
 
 
694 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  29.65 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.35 
 
 
523 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  24.63 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  26.02 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  24.28 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  25.71 
 
 
816 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.76 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  26.77 
 
 
807 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  23.69 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  24.72 
 
 
543 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1759  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.18 
 
 
571 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00340531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>