82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0386 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 340 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  41 
 
 		 731 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  44.16 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  39.36 
 
 		 504 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  32.31 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.7 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  36.62 
 
 		 570 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  34.69 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  40.96 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  38.75 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 		 167 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36 
 
 		 168 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  42.47 
 
 		 169 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 164 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 119 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  35.11 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.18 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  39.06 
 
 		 1048 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  38.71 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  44.93 
 
 		 154 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.54 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  37.36 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  30.14 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.67 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.67 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  40.79 
 
 		 161 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 357 aa  46.2  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 860 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  34.48 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  32.5 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  32.39 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.68 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.44 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  41.18 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  31.08 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 155 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1673  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  32.98 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  35.62 
 
 		 868 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.9 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  36.76 
 
 		 857 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  26.22 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 637 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  38.33 
 
 		 482 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 		 801 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.68 
 
 		 561 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  35.71 
 
 		 680 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.09 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.67 
 
 		 209 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 		 143 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 		 143 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 		 143 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  35.71 
 
 		 680 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  33.72 
 
 		 212 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  38.6 
 
 		 811 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 858 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 582 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 454 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  36.62 
 
 		 563 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>