20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1673 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1673  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2211  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.0478668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1672  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2656  putative permease  36.14 
 
 		 86 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0706  hypothetical protein  32.43 
 
 		 103 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0188915  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1471  hypothetical membrane spanning protein  32.43 
 
 		 103 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.597407  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29548  predicted protein  27.71 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.459222  normal  0.0446612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  36.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5832  hypothetical protein  34.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  28.97 
 
 		 731 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4213  hypothetical protein  29.58 
 
 		 85 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0660  putative permease  28.75 
 
 		 81 aa  45.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.24 
 
 		 340 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2780  hypothetical protein  29.63 
 
 		 88 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0712  putative permease  28.38 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0086  putative permease  30.49 
 
 		 80 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.117541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.66 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  30.26 
 
 		 677 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>