66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2211 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2211  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.0478668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1673  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.62 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.79 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29548  predicted protein  24.73 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.459222  normal  0.0446612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.97 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  31.18 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  31.87 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  33.7 
 
 		 419 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  32.61 
 
 		 412 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 409 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.89 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.7 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  22.86 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4028  Thioredoxin-disulfide reductase  29.41 
 
 		 538 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0134605  normal  0.10391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 157 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  22.61 
 
 		 419 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.45 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  27.36 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 597 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 408 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.61 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  22.83 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.39 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2760  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.378531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  26.13 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.2 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.24 
 
 		 747 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  28.04 
 
 		 449 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  24.37 
 
 		 425 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 		 425 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  28.09 
 
 		 409 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 		 227 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  24 
 
 		 177 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 224 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 		 224 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>