More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0129 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0129  hypothetical RNA pseudouridine synthase (RNA-uridine isomerase)  100 
 
 
249 aa  484  1e-136  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.22 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000212834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.89 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.67 
 
 
239 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1356  pseudouridine synthase  33.94 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1367  pseudouridine synthase  33.91 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1722  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.1 
 
 
398 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.950771  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2824  pseudouridine synthase, Rsu  33.62 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  34.16 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0851  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.65 
 
 
286 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000682568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1689  pseudouridine synthase  32.67 
 
 
379 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0924391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2691  RNA-binding S4 domain protein  30.74 
 
 
549 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1041  pseudouridine synthase, Rsu  33.19 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0593866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1855  pseudouridine synthase, Rsu  34.07 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  31.65 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1063  pseudouridine synthase  33.76 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1228  pseudouridine synthase, Rsu  31.09 
 
 
317 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000379641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0608  pseudouridine synthase, Rsu  34.44 
 
 
310 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.543804  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  33.2 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.98 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  35.15 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0743  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.06 
 
 
325 aa  128  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.405122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3519  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  31.65 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0646  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.29 
 
 
315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.945317  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.9 
 
 
240 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  32.22 
 
 
306 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19880  pseudouridine synthase family protein  31.73 
 
 
263 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2246  pseudouridine synthase  33.05 
 
 
293 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1089  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  31.76 
 
 
290 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  35.56 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  29.51 
 
 
274 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1691  pseudouridine synthase  33.48 
 
 
288 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2873  pseudouridine synthase  34.07 
 
 
736 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1556  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.46 
 
 
476 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0137817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1613  pseudouridylate synthase  33.46 
 
 
476 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02283  pseudouridine synthase (makes pseudouridine2605 in 23 S RNA)  30.71 
 
 
298 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2001  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.78 
 
 
686 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.850732  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.03 
 
 
255 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  28.19 
 
 
406 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  31.05 
 
 
274 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1159  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B (rRNA pseudouridylate synthase B)  32.49 
 
 
354 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  33.76 
 
 
264 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0462  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  32.35 
 
 
256 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2039  23S rRNA pseudouridylate synthase B  33.05 
 
 
344 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3394  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.33 
 
 
300 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000468714  normal  0.359184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1928  23S rRNA pseudouridylate synthase B  33.05 
 
 
318 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.521525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2309  23S rRNA pseudouridylate synthase B  33.05 
 
 
344 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  31.58 
 
 
273 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1753  RNA-binding S4 domain protein  30 
 
 
318 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.362888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  30.77 
 
 
256 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  29.36 
 
 
268 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1648  pseudouridine synthase  32.91 
 
 
290 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000180778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  29.91 
 
 
262 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2436  pseudouridine synthase, Rsu  32.76 
 
 
290 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2696  pseudouridine synthase  31.03 
 
 
291 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.764496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1467  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  31.2 
 
 
291 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.807732  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1533  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  31.2 
 
 
291 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000439021  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1669  RNA-binding S4 domain protein  31.03 
 
 
291 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00289659  hitchhiker  0.000456402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2124  pseudouridine synthase, Rsu  32.19 
 
 
295 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.380507  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2010  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.06 
 
 
294 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0800  pseudouridine synthase family 1 protein  31.93 
 
 
321 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2796  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.76 
 
 
291 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2717  pseudouridine synthase  31.76 
 
 
291 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2398  pseudouridine synthase  31.03 
 
 
291 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1525  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.77 
 
 
291 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2311  23S rRNA pseudouridylate synthase B  30.64 
 
 
294 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.909741  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003093  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  31.93 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00130129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3785  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.78 
 
 
354 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000422758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1437  pseudouridine synthase, Rsu  31.62 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1416  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.78 
 
 
355 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504489  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  29.66 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4002  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.78 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000006993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02753  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  31.93 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf286  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.2 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0185462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  27.23 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  29.88 
 
 
238 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1957  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.7 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2907  pseudouridine synthase  32.48 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191084  normal  0.0790045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2662  23S rRNA pseudouridylate synthase B  33.19 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.783064  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2201  23S rRNA pseudouridylate synthase B  32.35 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0829  pseudouridylate synthase  32.08 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15730  Pseudouridine synthase  30.8 
 
 
382 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00871  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  32.41 
 
 
546 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0441  pseudouridine synthase  32.33 
 
 
248 aa  118  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00343055  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3581  pseudouridine synthase, Rsu  30.22 
 
 
409 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0710  pseudouridine synthase  35.12 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1815  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.22 
 
 
408 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1846  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539759  hitchhiker  0.0000324002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1909  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000521291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  34.58 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1851  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  36.8 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1427  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.535105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  30.64 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  31.49 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1167  RNA-binding S4 domain protein  31.76 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1609  23S rRNA pseudouridylate synthase B  31.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  29.17 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0477  pseudouridine synthase  31.22 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  30.29 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>