194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4008 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  82.99 
 
 		 676 aa  993    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  83.88 
 
 		 673 aa  1020    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  97.93 
 
 		 676 aa  1138    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 676 aa  1304    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  83.88 
 
 		 673 aa  1020    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  83.88 
 
 		 673 aa  1020    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.28 
 
 		 699 aa  283  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.38 
 
 		 653 aa  279  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  33.62 
 
 		 664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  33.62 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 676 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  31.58 
 
 		 736 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  34.63 
 
 		 679 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.18 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  32.99 
 
 		 662 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  32.36 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  29.49 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  29.13 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  29.88 
 
 		 700 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  29.54 
 
 		 726 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.29 
 
 		 733 aa  187  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  29.07 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  29.11 
 
 		 725 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.75 
 
 		 733 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.27 
 
 		 742 aa  180  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.83 
 
 		 670 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  29.91 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  29.21 
 
 		 728 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.75 
 
 		 725 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  31.43 
 
 		 672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  29.75 
 
 		 725 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.02 
 
 		 741 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  29.75 
 
 		 725 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  28.25 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  29.42 
 
 		 725 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  29.87 
 
 		 726 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.1 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  28.93 
 
 		 711 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.51 
 
 		 722 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  29.17 
 
 		 635 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  29.35 
 
 		 714 aa  170  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  29.32 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.09 
 
 		 670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  28.7 
 
 		 691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  29.04 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  28.22 
 
 		 734 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  29.68 
 
 		 726 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  28.02 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  29.04 
 
 		 659 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  28.22 
 
 		 734 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  28.22 
 
 		 734 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  29.16 
 
 		 731 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.38 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 		 733 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  29.68 
 
 		 726 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  31.83 
 
 		 704 aa  161  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.42 
 
 		 653 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  29.13 
 
 		 733 aa  160  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  26.7 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  26.15 
 
 		 698 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.22 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.85 
 
 		 688 aa  157  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.28 
 
 		 623 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  27.06 
 
 		 727 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  30.67 
 
 		 682 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  29.9 
 
 		 727 aa  154  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.4 
 
 		 697 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  31.77 
 
 		 679 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.28 
 
 		 702 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  30.66 
 
 		 724 aa  151  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  29.15 
 
 		 727 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  30.53 
 
 		 679 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.9 
 
 		 672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.01 
 
 		 680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.25 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  30.73 
 
 		 679 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  31.19 
 
 		 724 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.39 
 
 		 691 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.03 
 
 		 641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  28.21 
 
 		 699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 625 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  27.41 
 
 		 728 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.8 
 
 		 679 aa  140  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  28.19 
 
 		 644 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  26.89 
 
 		 677 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  30.37 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.81 
 
 		 639 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.01 
 
 		 692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  27.91 
 
 		 688 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.32 
 
 		 695 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  27.05 
 
 		 670 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>