More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3163 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  100 
 
 
296 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  98.99 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  99.32 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  98.99 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  99.32 
 
 
296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  98.99 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  98.99 
 
 
316 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  95.27 
 
 
414 aa  557  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  88.18 
 
 
298 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  88.18 
 
 
298 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  88.51 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  87.84 
 
 
296 aa  487  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  88.18 
 
 
296 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  88.18 
 
 
296 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  87.16 
 
 
296 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  78.57 
 
 
299 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.59 
 
 
299 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  54.67 
 
 
300 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  54.3 
 
 
300 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  54.67 
 
 
301 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  54.74 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  54.33 
 
 
300 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  54.64 
 
 
298 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  53.61 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  56.49 
 
 
300 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  57.19 
 
 
300 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  52.45 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  56.49 
 
 
300 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 
300 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.78 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.77 
 
 
300 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.9 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.82 
 
 
292 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  44.07 
 
 
298 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.3 
 
 
299 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  45.1 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  46.82 
 
 
304 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.26 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  42.01 
 
 
309 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  42.41 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  42.41 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  42.07 
 
 
303 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  43.86 
 
 
307 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  38.52 
 
 
309 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  42.55 
 
 
308 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  39.71 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  39.45 
 
 
301 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  35.49 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 
295 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  35.37 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  43.15 
 
 
284 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  35.88 
 
 
307 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  37.76 
 
 
319 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.56 
 
 
301 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.02 
 
 
317 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  29.12 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  30.42 
 
 
296 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  27.87 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.16 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30.83 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  29.25 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  31.71 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  31.99 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.06 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  23.99 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.83 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.66 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  24.32 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25.18 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  23.81 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.66 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.15 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  25.09 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  22.66 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  22.66 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.32 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  31.5 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.32 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.86 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.03 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  30.92 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.08 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.1 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  26.35 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  30.53 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>