94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1701 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  66.09 
 
 
238 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  65.24 
 
 
234 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  80.66 
 
 
189 aa  304  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  55.36 
 
 
225 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  55.61 
 
 
260 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  54.3 
 
 
225 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  45.69 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  35.43 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  88.31 
 
 
84 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  40.8 
 
 
237 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  98.41 
 
 
64 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  43.26 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  38.85 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  37.24 
 
 
214 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  32.03 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  42.28 
 
 
179 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  32 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  34.44 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  80.77 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  35.46 
 
 
167 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  31.62 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  32.19 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  32.03 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  27.93 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  33.08 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.67 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  32.49 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.07 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  27.88 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.45 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.69 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1766  hypothetical protein  73.68 
 
 
73 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2378  hypothetical protein  73.68 
 
 
73 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  29.63 
 
 
199 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  27.93 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.86 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  26.95 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.46 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  28.93 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.06 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.27 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.08 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.2 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.08 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  29.14 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.78 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  26.43 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.76 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.51 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  34.78 
 
 
212 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  28.29 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.41 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  24.84 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  26.53 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.82 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  30.23 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  30.66 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  29.41 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  27.47 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  32.59 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  29.71 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  26.37 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  23.08 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.97 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  27.48 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  31.06 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.55 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1749  hypothetical protein  32.41 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  28.26 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  28.68 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  25.82 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  29.05 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.89 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  25.58 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  26.97 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  27.41 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  30.28 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.36 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  25.76 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  25.76 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  24.4 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  31.09 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  27.17 
 
 
212 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  30.16 
 
 
255 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.92 
 
 
233 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>