More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0922 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  100 
 
 
155 aa  311  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  94.16 
 
 
155 aa  292  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  85.16 
 
 
132 aa  252  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  63.76 
 
 
154 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  63.09 
 
 
154 aa  203  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  63.33 
 
 
153 aa  203  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  60.42 
 
 
144 aa  190  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  64.34 
 
 
149 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  65.97 
 
 
150 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 
150 aa  176  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 
149 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  60.14 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
153 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  53.79 
 
 
174 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
157 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 
153 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
158 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
152 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
152 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
153 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
153 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.99 
 
 
153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
157 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  45.7 
 
 
169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
160 aa  133  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
155 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  49.28 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
162 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
165 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  44 
 
 
153 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
155 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.94 
 
 
152 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  43.33 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
154 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 
157 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
157 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
156 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 
155 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  42.07 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  42.07 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  42.07 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  45.38 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  40.56 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  45.38 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  45.38 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
229 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40.27 
 
 
229 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.69 
 
 
152 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
155 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>