245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0872 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  99.63 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  86.89 
 
 		 263 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  59.48 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.2 
 
 		 267 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.65 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  53.95 
 
 		 271 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.53 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  46.19 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.96 
 
 		 295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  42.66 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.62 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  40.18 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  44.06 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.07 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  37.78 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  40.37 
 
 		 300 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  42.57 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  42.36 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  38.2 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  43.07 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.43 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  42.08 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.74 
 
 		 684 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.94 
 
 		 2413 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  32.93 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1402 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.61 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.5 
 
 		 831 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  27.64 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.12 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.48 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  32.7 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.56 
 
 		 528 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1493 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.69 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1037 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1032 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.73 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.54 
 
 		 961 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 685 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.55 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 976 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.79 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.58 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.59 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.59 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.14 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.4 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.57 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.97 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1002 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.41 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.2 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  33.01 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.46 
 
 		 890 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.86 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.51 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.57 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.45 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.65 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.14 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.85 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1281 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.1 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.19 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  29.45 
 
 		 839 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.27 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.16 
 
 		 961 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.12 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2358  Sel1  33.33 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  31.06 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  39.36 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  31.29 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  32.12 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  31.06 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.21 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  26.92 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.78 
 
 		 552 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.36 
 
 		 373 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.57 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  30.24 
 
 		 817 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0657  Sel1 domain-containing protein  32.41 
 
 		 439 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.33 
 
 		 746 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.99 
 
 		 348 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 		 798 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 410 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.67 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>