140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1526 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1526  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  100 
 
 		 348 aa  702    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0153  thiamine biosynthesis lipoprotein, ApbE family  34.92 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.191913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  35.84 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  40.89 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2360  ApbE family lipoprotein  37.3 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000706086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  28.5 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  28.02 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  26.88 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  28.64 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.98 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  27.31 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  24.9 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  24.79 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.01 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.01 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.68 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  23.01 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  23.01 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  23.01 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.01 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  23.01 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.01 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.29 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  26.83 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.01 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  24.48 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.27 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.58 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  26.05 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.95 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  24.89 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  27.12 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.14 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  25.19 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.44 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.45 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  24.8 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  27.47 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.58 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.58 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.58 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  25.22 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  20.88 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  28.28 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  25.48 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.79 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  24.56 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.01 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  26.89 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.42 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.08 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.51 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  24.24 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  29.95 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  24.41 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.74 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  24.35 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.12 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.7 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  31.65 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  26.73 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  26.73 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.97 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  26.82 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  22.91 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  24.36 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  26.11 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.37 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  23.03 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  22.52 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  25 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  28.49 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.5 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  22.9 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  24.88 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  28.49 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  27.27 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  28.49 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  24.85 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.5 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>