More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1327 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1327  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
350 aa  725    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  81.71 
 
 
350 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  60.81 
 
 
345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 
342 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
342 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  56.9 
 
 
342 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  58.62 
 
 
342 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  61.06 
 
 
343 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  60.76 
 
 
342 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
342 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
342 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
339 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
340 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
331 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  59 
 
 
342 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  56.1 
 
 
331 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
333 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  55.79 
 
 
331 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 
329 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 
329 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
337 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 
341 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  54.17 
 
 
338 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 
341 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
341 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 
338 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
337 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
330 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  58.94 
 
 
343 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
330 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  55.83 
 
 
331 aa  368  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  56.57 
 
 
338 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 
329 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
330 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 
331 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
338 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
330 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
331 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 
336 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
330 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
331 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 
329 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
330 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
338 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
331 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
331 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  52.98 
 
 
338 aa  362  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 
338 aa  362  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  54.63 
 
 
331 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  53.47 
 
 
340 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
329 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 
330 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  54.91 
 
 
333 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  56.48 
 
 
338 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  54.91 
 
 
331 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  55.76 
 
 
331 aa  358  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  58.02 
 
 
331 aa  358  6e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
330 aa  358  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  56.05 
 
 
342 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  54.94 
 
 
333 aa  358  9e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
327 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
331 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
337 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  53.33 
 
 
340 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  55.86 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  55.56 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 
330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  56.75 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  53.35 
 
 
340 aa  355  5.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  55.15 
 
 
337 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  53.35 
 
 
359 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  51.8 
 
 
335 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  55.29 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  56.75 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  55.96 
 
 
331 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
338 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 
329 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
338 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  55.96 
 
 
338 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
330 aa  352  8e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  55.56 
 
 
338 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  50.88 
 
 
340 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  54.27 
 
 
337 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  54.6 
 
 
338 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  55.96 
 
 
331 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  53.12 
 
 
339 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  50.88 
 
 
340 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 
330 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
339 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
329 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
338 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
338 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 
338 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  54.98 
 
 
333 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>