More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1087 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  100 
 
 		 943 aa  1900    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 		 792 aa  800    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 		 749 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 758 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.12 
 
 		 757 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 		 756 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.45 
 
 		 733 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.72 
 
 		 747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.12 
 
 		 747 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 		 723 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 718 aa  396  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 746 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.19 
 
 		 760 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.94 
 
 		 748 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.94 
 
 		 750 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 725 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.25 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.61 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.22 
 
 		 750 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 741 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.31 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  41.49 
 
 		 739 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.57 
 
 		 778 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  39.47 
 
 		 741 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 		 781 aa  360  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.38 
 
 		 752 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.74 
 
 		 753 aa  352  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.47 
 
 		 737 aa  340  8e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.16 
 
 		 726 aa  340  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  35.53 
 
 		 739 aa  333  9e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 741 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 741 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 741 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.93 
 
 		 704 aa  325  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.05 
 
 		 819 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.98 
 
 		 818 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 819 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.13 
 
 		 700 aa  305  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.94 
 
 		 695 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.76 
 
 		 818 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 		 702 aa  302  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.06 
 
 		 689 aa  301  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  32.01 
 
 		 818 aa  300  7e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.22 
 
 		 701 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.54 
 
 		 688 aa  298  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.07 
 
 		 696 aa  297  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.01 
 
 		 740 aa  295  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.45 
 
 		 698 aa  293  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.79 
 
 		 728 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.26 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.35 
 
 		 706 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.41 
 
 		 737 aa  290  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.39 
 
 		 692 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 		 715 aa  290  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 		 703 aa  290  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.07 
 
 		 671 aa  289  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.86 
 
 		 702 aa  287  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 671 aa  287  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.22 
 
 		 693 aa  286  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.3 
 
 		 701 aa  286  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.97 
 
 		 685 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 715 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.02 
 
 		 692 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.32 
 
 		 747 aa  280  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.39 
 
 		 692 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 723 aa  280  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.81 
 
 		 676 aa  279  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.18 
 
 		 690 aa  280  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 723 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.72 
 
 		 776 aa  280  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.58 
 
 		 665 aa  279  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.23 
 
 		 692 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 708 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.13 
 
 		 678 aa  278  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.06 
 
 		 690 aa  278  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.85 
 
 		 805 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2085  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.12 
 
 		 808 aa  278  5e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.18 
 
 		 753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5068  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.74 
 
 		 709 aa  276  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.72 
 
 		 672 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 		 717 aa  273  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.48 
 
 		 689 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 		 693 aa  270  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 694 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 		 736 aa  268  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.34 
 
 		 822 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.96 
 
 		 691 aa  266  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.33 
 
 		 671 aa  265  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.338376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.6 
 
 		 691 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  30 
 
 		 690 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.93 
 
 		 691 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  35 
 
 		 695 aa  262  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.84 
 
 		 564 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.08 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.75 
 
 		 681 aa  258  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.32 
 
 		 686 aa  258  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  36.45 
 
 		 699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>