More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0244 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  100 
 
 
415 aa  833    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  48.7 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.58 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.95 
 
 
384 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.46 
 
 
384 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  45.98 
 
 
400 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.98 
 
 
394 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.66 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  44.87 
 
 
377 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.49 
 
 
399 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.69 
 
 
398 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.79 
 
 
392 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  40.72 
 
 
394 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.03 
 
 
404 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40 
 
 
382 aa  279  5e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.35 
 
 
393 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.21 
 
 
379 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  43.91 
 
 
391 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.16 
 
 
388 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.44 
 
 
388 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.8 
 
 
382 aa  277  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  43.81 
 
 
387 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  45.83 
 
 
388 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.97 
 
 
392 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  43.48 
 
 
391 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.44 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  42.53 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.92 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  44.36 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.07 
 
 
392 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  38.96 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.57 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  41.47 
 
 
399 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  43.11 
 
 
388 aa  272  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  42.53 
 
 
422 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.77 
 
 
395 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.56 
 
 
409 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  37.97 
 
 
383 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  43.61 
 
 
400 aa  269  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.69 
 
 
396 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.95 
 
 
414 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.34 
 
 
398 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  42.78 
 
 
407 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.18 
 
 
381 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  43.54 
 
 
401 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  43.08 
 
 
418 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.43 
 
 
403 aa  262  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  41.69 
 
 
387 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.69 
 
 
396 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  41.22 
 
 
412 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  42.04 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.12 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.66 
 
 
398 aa  259  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  41.13 
 
 
400 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.44 
 
 
398 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.44 
 
 
398 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  43.19 
 
 
397 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.78 
 
 
394 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  43.19 
 
 
397 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  43.19 
 
 
397 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  44.68 
 
 
380 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.36 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  46.86 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  42.71 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.23 
 
 
400 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.4 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.82 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.14 
 
 
389 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.6 
 
 
381 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  41.07 
 
 
397 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  41.41 
 
 
401 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  37.85 
 
 
381 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  42.71 
 
 
419 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  38.12 
 
 
382 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.6 
 
 
381 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  39.18 
 
 
402 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.85 
 
 
381 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  38.72 
 
 
400 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.6 
 
 
381 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  37.95 
 
 
402 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.18 
 
 
404 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.56 
 
 
402 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.55 
 
 
380 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  40.83 
 
 
413 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  39.69 
 
 
390 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  43.91 
 
 
424 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.07 
 
 
399 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.41 
 
 
394 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.34 
 
 
381 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.13 
 
 
391 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  37.08 
 
 
381 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  39.02 
 
 
397 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  43.91 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.34 
 
 
381 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.34 
 
 
381 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  36.83 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>