More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2581 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  100 
 
 		 333 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  51.48 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1921  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  hitchhiker  0.00212395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2172  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0951  alpha/beta hydrolase fold  48.48 
 
 		 95 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1709  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000106248  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34884  predicted protein  24.35 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.435198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.7 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.38 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.38 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.38 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.66 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.98 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.38 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  20.98 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.66 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  20.66 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  28.09 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  37.78 
 
 		 442 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06950  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.37 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0105  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  25.66 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  27.17 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  30.3 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  25.09 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  31.2 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  24.87 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  29.96 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  28.66 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.06 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.68 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  23.06 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  27.94 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  27.05 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  29.31 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  23.51 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.83 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  30.83 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  33.09 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  24.72 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  28.21 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  25.42 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>