93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1533 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
322 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  28.37 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  22.71 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.95 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  32.43 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  31.11 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
248 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.33 
 
 
314 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.16 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.38 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
332 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
354 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  36.67 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
282 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.45 
 
 
335 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  32.14 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  34.55 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
272 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  34.55 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  34.55 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  34.55 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  30.36 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.47 
 
 
297 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  31.46 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  31.71 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  34.55 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  34.55 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  34.55 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  33.96 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  21.76 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  33.05 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  27.03 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.97 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 
461 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1709  alpha/beta hydrolase fold  21.07 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000106248  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  32.48 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
258 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  23.34 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  30.63 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  30.63 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  30.63 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  20.46 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
257 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2755  hypothetical protein  30.08 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0392069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  30.51 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>