163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2897 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 344 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  52.47 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2172  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1921  Alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  hitchhiker  0.00212395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0951  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1709  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000106248  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  24.03 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  24.69 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.51 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.51 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52615  predicted protein  24.74 
 
 		 270 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0440889  normal  0.692936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.1 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 278 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  41.67 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  19.86 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  19.86 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.45 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  26.56 
 
 		 265 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  39.29 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.46 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  19.93 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.74 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  28.31 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  39.29 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  39.29 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  35.96 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  35.94 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.84 
 
 		 721 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  23.88 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  34.43 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.1 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  31.78 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  27.2 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.52 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 		 567 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  25.56 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  24.42 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 559 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.52 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  42.5 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  27.71 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06950  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 461 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  24.81 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 262 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 		 241 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.71 
 
 		 364 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47288  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.451932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.04 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  34.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  20.41 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>