50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1709 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1709  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000106248  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  26.25 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1921  Alpha/beta hydrolase fold  24.85 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  hitchhiker  0.00212395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2172  alpha/beta hydrolase fold protein  20.98 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.19 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  28.23 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.67 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02911  hydrolase  23.86 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  21.85 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  22.31 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  24.65 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.61 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.24 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  21.07 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  27.15 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  27.27 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  25.71 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  25.71 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  27.15 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  28.9 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  23.94 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  25.71 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  27.15 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  28.9 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>