128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47288 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_47288  conserved hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  972    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.451932  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44442  predicted protein  35.61 
 
 
443 aa  242  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  31.52 
 
 
491 aa  219  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00570  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 
634 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351381  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46178  predicted protein  29.48 
 
 
445 aa  157  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  28.01 
 
 
494 aa  123  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29727  predicted protein  23.59 
 
 
511 aa  60.1  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990942  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  24.49 
 
 
320 aa  57.4  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.56 
 
 
323 aa  56.6  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  33.87 
 
 
302 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
368 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 
304 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
341 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  25.79 
 
 
333 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
504 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  26.54 
 
 
331 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  26.76 
 
 
341 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  26.42 
 
 
333 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  24.84 
 
 
339 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  29.67 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
831 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
332 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
293 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  29.67 
 
 
304 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
562 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
284 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
275 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  28.87 
 
 
353 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
293 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
336 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
339 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  26.11 
 
 
346 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
296 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 
291 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.91 
 
 
291 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
877 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 
290 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 
304 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
276 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
296 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
353 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
290 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
297 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 
291 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.74 
 
 
295 aa  47  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
335 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 
291 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.91 
 
 
291 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
332 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 
291 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  26.47 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.56 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
290 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  26.57 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 
278 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  30.61 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  31.2 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
278 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  26.06 
 
 
355 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  28.8 
 
 
292 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  31 
 
 
299 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  24.49 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  31.73 
 
 
272 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
281 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 
329 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>