14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34884 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34884  predicted protein  100 
 
 
401 aa  834    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.435198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02911  hydrolase  32.76 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  24.35 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  20.58 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.04 
 
 
264 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  20.68 
 
 
255 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  30.47 
 
 
269 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.29 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.51 
 
 
264 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  24.41 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  23.94 
 
 
306 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
265 aa  42.7  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>