More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0874 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  67.67 
 
 		 233 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  68.24 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  65.95 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  45.89 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  35.19 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  29.33 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 251 aa  121  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  38.14 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  36.52 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  33.62 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  30.57 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  30.57 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  29.33 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.15 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.06 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.39 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  24.78 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.46 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.46 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.46 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.68 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  29.34 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.58 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.56 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.2 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.9 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.57 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.81 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  33.51 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  29.26 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.89 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.65 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.89 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  26.86 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  26.96 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 		 393 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.86 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  29.35 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.25 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.9 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>