More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0710 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  85.08 
 
 		 246 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.89 
 
 		 246 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  86.64 
 
 		 247 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  85.89 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  85.83 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2069  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.98 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  66.39 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.39 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  64.58 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  62.96 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.14 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.21 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  44.94 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  44.94 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  46.06 
 
 		 239 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  44.13 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  43.03 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  38.84 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.35 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  45.56 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  45.56 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  43.03 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  42.32 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  44.73 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  41.49 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.39 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  43.67 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  38.43 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  43.67 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  43.5 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  43.27 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  43.27 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  43.27 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  41.06 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  43.65 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  44.86 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.56 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.7 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  43.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  44.02 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  47.53 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  44.67 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  47.53 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.74 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  46.85 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  41.63 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  42.86 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>