More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0254 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  976    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  63.47 
 
 		 481 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  55.21 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  52.32 
 
 		 455 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  50.44 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  46.52 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  44.49 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  37.94 
 
 		 776 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 		 523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.45 
 
 		 459 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 489 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.24 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.99 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  30.63 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 496 aa  192  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  37.41 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  29.96 
 
 		 561 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.23 
 
 		 506 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  38.79 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 573 aa  170  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  36.03 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  28.63 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 608 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 569 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.06 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 609 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  35.49 
 
 		 588 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 581 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 582 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.44 
 
 		 706 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.92 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.72 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.51 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.72 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2526  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.85 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.71 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  28.86 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.15 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.1 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.14 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 1000 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.5 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.63 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.71 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.92 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.88 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.99 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.7 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.48 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.48 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>