275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS5041 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  100 
 
 
234 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  97.01 
 
 
234 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  95.73 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  85.47 
 
 
234 aa  420  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  75.21 
 
 
234 aa  374  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  84.74 
 
 
190 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  83.16 
 
 
190 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  82.63 
 
 
190 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  62.39 
 
 
234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  45.34 
 
 
230 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  43.22 
 
 
235 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
224 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
216 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.22 
 
 
226 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  32.2 
 
 
221 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
229 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  32.77 
 
 
220 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
259 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  30.49 
 
 
230 aa  99  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  30.9 
 
 
224 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  28.76 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  28.76 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.31 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
242 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.44 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.49 
 
 
242 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  31.05 
 
 
245 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.96 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
279 aa  85.1  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  29.51 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  29.69 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  28.63 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  26.07 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.47 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.03 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.2 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.23 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  32.11 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.23 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.16 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.09 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  28.16 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  27.72 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  30.41 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.64 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  29.84 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.05 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.84 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.53 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.18 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  25.23 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.51 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.16 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.91 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  26.89 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.7 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  27.54 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  27.05 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  27.31 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  28.57 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  27.57 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  29.17 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
276 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  27.64 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  31.42 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  29.17 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  27.06 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  30.19 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  27.48 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  35.11 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>