299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  50.78 
 
 
327 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  41.19 
 
 
326 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  40.88 
 
 
326 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  39.31 
 
 
326 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  38.75 
 
 
336 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 
324 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  37.81 
 
 
325 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  38.98 
 
 
335 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  35.9 
 
 
324 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 
353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  35.99 
 
 
326 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  39.06 
 
 
326 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
335 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  35.26 
 
 
324 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  38.17 
 
 
332 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  35.24 
 
 
342 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  37.42 
 
 
333 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
332 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  37.63 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
331 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  39.18 
 
 
332 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 
325 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  37.78 
 
 
332 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 
325 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 
346 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 
337 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  37.87 
 
 
324 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  36.56 
 
 
335 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  37.14 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
327 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  38.87 
 
 
332 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  37.78 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 
325 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 
325 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
324 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  36.56 
 
 
335 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  36.56 
 
 
335 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  35.22 
 
 
325 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  35.87 
 
 
332 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
327 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  36.99 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  36.53 
 
 
337 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 
331 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  38.18 
 
 
336 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
329 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  39.29 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 
341 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  37.22 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  34.22 
 
 
324 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  30.26 
 
 
339 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  35.33 
 
 
334 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
325 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  42.05 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
306 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.88 
 
 
223 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 
319 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
299 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
301 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  30.66 
 
 
314 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.55 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.08 
 
 
301 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  26.59 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 
307 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
302 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.02 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 
300 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  26.93 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 
313 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
306 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 
318 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.36 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.36 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
307 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
315 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>