54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9851 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  100 
 
 		 486 aa  982    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  74.95 
 
 		 488 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  80.67 
 
 		 487 aa  722    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  42.92 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  42.7 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  41.91 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  41.89 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  43.81 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  43.91 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  43.85 
 
 		 543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  46.68 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  46.37 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  40.13 
 
 		 498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  37.92 
 
 		 486 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  42.8 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 535 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  39.66 
 
 		 501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  40.04 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  37.72 
 
 		 476 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  39.27 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  40.49 
 
 		 498 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  39.82 
 
 		 554 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  39.82 
 
 		 554 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  38.57 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  38.57 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  39.82 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  39.51 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  40.17 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  39.09 
 
 		 486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  39.57 
 
 		 536 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  39.66 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  39.66 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  40.44 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  39.78 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  39.35 
 
 		 523 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  37.02 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  34.99 
 
 		 465 aa  224  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  34.99 
 
 		 465 aa  224  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  32.47 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  34.26 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  34.24 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  33.33 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  35.24 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  31.63 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  33.92 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  32.76 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  36.49 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  36.52 
 
 		 477 aa  192  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  32.85 
 
 		 475 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  30.66 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  33.43 
 
 		 438 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>