112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2978 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  100 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  65.6 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.25 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  63.03 
 
 		 286 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.85 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  66.55 
 
 		 287 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  61.54 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  61.54 
 
 		 288 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  63.73 
 
 		 288 aa  331  9e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  61.54 
 
 		 289 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  61.89 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.03 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  63.2 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  66.42 
 
 		 285 aa  325  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  63.2 
 
 		 295 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  61.13 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  63.38 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.32 
 
 		 287 aa  321  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  61.84 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  59.51 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  62.69 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  62.19 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  62.19 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  62.19 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.96 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  63.73 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  63.03 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  62.54 
 
 		 295 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  57.65 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  60.56 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.02 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  63.02 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.92 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  56.7 
 
 		 305 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.82 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  53.73 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  42.27 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  43.58 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  43.58 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  43.2 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  42.91 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  42.91 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  42.91 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  44.14 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.43 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  42.57 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.1 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  42.76 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  43.88 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  40.64 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  43 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  44.22 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  40.73 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  42.01 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.56 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  38.62 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  40.83 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  41.67 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  36.4 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.81 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  40.14 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  39.73 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  37.63 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.32 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  37.41 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  41.52 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  42.75 
 
 		 317 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.24 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.36 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  32.5 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.32 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.02 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  26.5 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  31.58 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  26.19 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  37.84 
 
 		 395 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  26.1 
 
 		 286 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  28.09 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.21 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  30.81 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  20.51 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>