148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2874 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 337 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.27 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.21 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.69 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.8 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.82 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.1 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.4 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.9 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.76 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  63.89 
 
 		 74 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  32.12 
 
 		 848 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.1 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 166 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.57 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 		 162 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.76 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.59 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.06 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  32.39 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.96 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  24.1 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.65 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.96 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  30.09 
 
 		 148 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 148 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 		 167 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 162 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.04 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  30.68 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  36 
 
 		 164 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 1031 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  33.09 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 163 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  27.55 
 
 		 163 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 		 160 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  27.36 
 
 		 2151 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 170 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  29.55 
 
 		 167 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 148 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  29.55 
 
 		 163 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  30.51 
 
 		 173 aa  45.8  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>