73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1776 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  964    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  49.15 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  48.51 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  41.46 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  33.1 
 
 		 498 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  32.01 
 
 		 812 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  26.68 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  27.23 
 
 		 506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  27.63 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.85 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.13 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.03 
 
 		 528 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  24.81 
 
 		 506 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.64 
 
 		 596 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.64 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 496 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  29.08 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 497 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  26.23 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.82 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  28.76 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.12 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  31.35 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  29.25 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  29.76 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 503 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  26.85 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  26.85 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.68 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.55 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.89 
 
 		 864 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.56 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.98 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  25.18 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  26.24 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  27.66 
 
 		 611 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  25.1 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  25.57 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  29.76 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  26.96 
 
 		 550 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  26.96 
 
 		 550 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.28 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.8 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  27.49 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  26.87 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.35 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.29 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 520 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  25.87 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  24.28 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  24.28 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25.54 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3624  glycosyltransferase  51.67 
 
 		 587 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  39.52 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  24.08 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  25.28 
 
 		 506 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 502 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  21.85 
 
 		 526 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>