117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0200 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1075    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  66.25 
 
 		 561 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  66.15 
 
 		 574 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  49.39 
 
 		 639 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  44.05 
 
 		 641 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  50.18 
 
 		 531 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  49.1 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  48.58 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  49.8 
 
 		 529 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  45.99 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  40.84 
 
 		 666 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  40.84 
 
 		 666 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  40.8 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  44.06 
 
 		 530 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  42.93 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  40.77 
 
 		 571 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  42.94 
 
 		 604 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  38.42 
 
 		 551 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  42.27 
 
 		 550 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  43.03 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  41.29 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  40.15 
 
 		 550 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  39.78 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  42.44 
 
 		 622 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  39.93 
 
 		 658 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  38.36 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  35.57 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  35.57 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  37.24 
 
 		 586 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  37.24 
 
 		 586 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  36.99 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  36.94 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  36.25 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  39.96 
 
 		 543 aa  279  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  37.91 
 
 		 531 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  38.22 
 
 		 548 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  38.74 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  36.56 
 
 		 643 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  34.61 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  39.15 
 
 		 645 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  40.1 
 
 		 632 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  36.2 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  35.19 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  37.5 
 
 		 513 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  36.08 
 
 		 543 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  34.7 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  36.55 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  34.21 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  37.52 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.39 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.97 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  35.39 
 
 		 528 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  33.85 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  56.85 
 
 		 629 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  41.11 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  33.09 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  33.98 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  50.29 
 
 		 188 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  39.78 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  30.36 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  37.5 
 
 		 450 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  29.11 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  42.52 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  50 
 
 		 262 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  50 
 
 		 262 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  26.56 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  24.87 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.66 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  27.2 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.45 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  26.22 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  32.28 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  29 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  23.41 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  25.7 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.27 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  41.07 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.39 
 
 		 946 aa  64.3  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  25.56 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.62 
 
 		 932 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.24 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  24.51 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  26.95 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  35.21 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  30 
 
 		 361 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  27.73 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27.32 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  35.42 
 
 		 424 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  42.86 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  40.43 
 
 		 1036 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  29.13 
 
 		 255 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  25.35 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  37.88 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  35.64 
 
 		 408 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  29.37 
 
 		 400 aa  50.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.24 
 
 		 1821 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  32.81 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>