More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3081 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  80.3 
 
 		 227 aa  338  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  51.92 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  50.66 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  50.45 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  50.45 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.36 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  40.62 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  41.2 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.2 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.55 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.74 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.53 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  46.23 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.25 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  42.93 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.37 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  43.87 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  40.09 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43.33 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  43.54 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  38.99 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.1 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40.85 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.94 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.63 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.91 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  38.91 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  41.01 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.64 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  39.71 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.91 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.63 
 
 		 242 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  39.17 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  39.51 
 
 		 282 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  39.64 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  41.18 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.09 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.87 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  39.8 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  37.22 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.67 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.67 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.73 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.96 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  35.02 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.17 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.1 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.1 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.35 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.74 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.89 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  37.38 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.14 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.07 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.04 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  38.01 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.84 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  39.11 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  36.73 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.72 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  38.25 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  37.16 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  37.44 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.87 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.46 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  40.57 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.79 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  40.55 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  36.53 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  37.73 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  36.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  36.53 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.21 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  37.44 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.28 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  35.5 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.67 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  38.07 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  36.7 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  35.98 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  37.16 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  37.16 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  37.39 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.24 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  37.07 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.16 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  38.05 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>