58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2745 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  100 
 
 
139 aa  280  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  76.64 
 
 
139 aa  206  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  55.38 
 
 
127 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  45.99 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  54.1 
 
 
133 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  46.27 
 
 
119 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  42.64 
 
 
143 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  49.23 
 
 
128 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  44.62 
 
 
119 aa  114  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  43.41 
 
 
119 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  43.41 
 
 
119 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  48.72 
 
 
116 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  45.38 
 
 
126 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  47.86 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  53.85 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  47.86 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  52.88 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  46.15 
 
 
116 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  50 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  35.45 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  31.9 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  30.43 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  34.81 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  33.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.31 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  35.64 
 
 
807 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  30.22 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  29.82 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  33.03 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  31.06 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  32.73 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  28.81 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  35.11 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  33.04 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  30.63 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  33.66 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  37.08 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  31.53 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  31.09 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  28.12 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  30.65 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  35.51 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  41.67 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  33.68 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.26 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  33.77 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  33.03 
 
 
318 aa  42.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.82 
 
 
417 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  28.81 
 
 
137 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  27.97 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  32 
 
 
224 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  30.3 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  30 
 
 
347 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  30.34 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  27.56 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.77 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  30.85 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  26.67 
 
 
212 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>