78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1598 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  100 
 
 
340 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  78.39 
 
 
325 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  70.7 
 
 
318 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  70.38 
 
 
318 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  68.75 
 
 
307 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  65.81 
 
 
319 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  66.13 
 
 
321 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  63.02 
 
 
336 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  38.87 
 
 
330 aa  198  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.35 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.5 
 
 
565 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
329 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
390 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 
326 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  38.19 
 
 
368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  37.15 
 
 
380 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  36.53 
 
 
321 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.61 
 
 
419 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.31 
 
 
389 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  37.58 
 
 
327 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  35.58 
 
 
351 aa  175  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 
826 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
881 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.5 
 
 
737 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.39 
 
 
393 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  37.03 
 
 
859 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.43 
 
 
741 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  37.46 
 
 
856 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  35.38 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  36.71 
 
 
859 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  36.71 
 
 
859 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  36.71 
 
 
859 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  36.19 
 
 
859 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  34.27 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  33.72 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  35.9 
 
 
372 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  34.41 
 
 
352 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  36.34 
 
 
860 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  36.34 
 
 
836 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  33.62 
 
 
838 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  34.6 
 
 
392 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  33.93 
 
 
792 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  37.73 
 
 
884 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.84 
 
 
737 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  34.81 
 
 
857 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  35 
 
 
841 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.59 
 
 
863 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  36.2 
 
 
944 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  35.08 
 
 
841 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  34.24 
 
 
867 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
800 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  34.38 
 
 
820 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  35.82 
 
 
899 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  34.73 
 
 
779 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.49 
 
 
757 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  34.04 
 
 
842 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  35.11 
 
 
380 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  34.35 
 
 
871 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  33.99 
 
 
852 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.73 
 
 
875 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  33.43 
 
 
416 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
859 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  34.59 
 
 
811 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  33.64 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.54 
 
 
872 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.15 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.54 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.65 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  24.73 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  23.83 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.9 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.52 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.92 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  23.49 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>